Свръхпроводящите магнити се правят чрез използване на феномена, че съпротивлението на свръхпроводящите материали намалява до нула при определена температура. Те обикновено са изработени от материал от ниобиево-титанова сплав и се охлаждат с течен хелий (4.2K). Когато токът преминава през магнитната бобина, след магнитното поле изключете захранването, за да образувате стабилно и равномерно магнитно поле. Магнитът поддържа бобината под критичната температура чрез хладилния агент и не е необходимо допълнително захранване.

Свръхпроводящите магнити могат да произведат по-висока сила на магнитното поле, по-добра стабилност на магнитното поле и еднородност на магнитното поле. Това означава по-добро качество на изображението, по-добро съотношение сигнал/шум, контраст и разделителна способност и по-бърза скорост на изображението.

Конвенционалните свръхпроводящи магнити обикновено имат вареловидна структура, която е предразположена към потенциална "клаустрофобия" и не е благоприятна за лекарски операции и наблюдение на признаци на домашни любимци под анестезия. В допълнение, тъй като конвенционалният свръхпроводящ магнит има по-голямо разсеяно магнитно поле, е необходима по-голяма площ за инсталиране на устройството.